故事舞台是在机动战士高达中的一年战争终结后七年。战争结束后一部份吉恩公国军事势力并未降伏继续在各地与地球联邦军发生军事冲突，因此地球联邦军内部强力主张追杀吉恩残余份子的激进排他势力泰坦斯（Titans）结成。由于泰坦斯对宇宙住民的强硬血腥镇压的手段，反势力奥干A.E.U.G.(台湾翻译为奥干，港译为奥古)结成。故事的开始于宇宙世纪0087年（U.C.0087），前半主要围绕奥干和泰坦斯两派系的对抗...

战后复兴的东京，、少年侦探金田正太郎和他的“铁人28号”一起解决了一个接着一个的困难事件。但是在战争中行踪不明的正太郎的哥哥出现在了正太郎面前。（正太郎的哥哥也叫正太郎，故下面用SHOUTAROU代替）。为了战争而接受铁人操控训练后返回日本的SHOUTAROU却得知了博士的遗言为“将铁人留给弟弟正太郎”。而现在的日本也已恢复了和平，他的存在似乎变得毫无价值。但SHOUTAROU还是接受了这个现实，...